“第三次……世界大戰……”
岡部難以置信地聽著阿萬音鈴羽的話語。β世界線的殘酷，依舊在時間線的遠方等待著自己和身邊自己所重視的人們。
面對已經受夠了時間跳躍，不想再改變世界線的岡部，阿萬音鈴羽冷漠地說道：
“岡部倫太郎，如果我說要避免世界大戰的發生，需要的是拯救在2010年7月28日死去的牧瀨紅莉棲的話呢。”
“什么意思？！”聽到不再是“打工戰士”的鈴羽的話，岡部震驚地望著她。
“詳細的情況我并不清楚，但是我接到的任務只有一個，拯救牧瀨紅莉棲，前往唯一不受世界線收束范圍影響的世界線——steins gate！”阿萬音鈴羽如此說道。
在本村哉志和岡部一樣震驚的目光中，畫面轉向了OP。標題的Steins；Gate在這一刻緊緊地抓住了本村哉志的心，一切的線索都從第一季開始在腦海中理順下來，原來，牧瀨紅莉棲的死，也不是結局嗎？
那么岡部究竟要如何拯救死于2010年7月28日的牧瀨紅莉棲呢？
OP的歌詞悄然變換。
“生命的論點和無意義的證明，對你而言，是就連消遣也算不上的滑稽。”
“自稱支配者的愚蠢種族，陳列出狂妄自大的幼稚定理~”
“為此面對欺騙時間，所剩下的裝置，不會再有迷茫，孤獨的觀測者啊~”
早就被OP俘虜的本村哉志沒有跳OP的意思，和之前的OP不同，這里的OP歌手聲線中潛藏的悲傷的壓抑似乎都消失了，取而代之的卻是希望堅持，就像是不再迷茫的孤獨觀測者一般。
懷著對接下來發展的疑惑，本村哉志注視著岡部和鈴羽乘坐時間機器回到了2010年7月28日，那個α世界線中牧瀨紅莉棲被殺死的那天。
當時牧瀨紅莉棲對尚在中二時期的岡部倫太郎所說的話就非常地讓本村哉志在意，現在看來，果然是岡部進行了時間旅行產生的不和諧之處。
乘坐時間機器而來的岡部為了不產生時間悖論，避開了原來時間線上的岡部和真由理，在繞路前去八樓的時候，他遇到了紅莉棲。
無法壓抑自己心情的岡部被紅莉棲視作了怪人，但是廣播館里的廣播喚醒了他的意識，讓他離開了那里，來到了自己曾經目睹紅莉棲死亡的地方。
在這里等待了一會兒，紅莉棲果然也出現在了門口，然而她等待的人，卻讓岡部一驚。
中鈸博士來到了這里，紅莉棲居然對他喊出了“爸爸”，原來，牧瀨紅莉棲的父親就是中鈸博士嗎！？
紅莉棲整合了自己的理論，得到了時間機器原理的論文，她本來想要和父親中鈸博士一起署名發表，中鈸卻只想要竊據女兒的研究成果，父女倆之間因此起了爭執，難以忍受紅莉棲被中鈸傷害，岡部憤怒地沖了出去。
原來中鈸就是紅莉棲那個因為研究時間機器而被協會除名，因此在學界名落千丈的父親，也是因此，中鈸才會將自己優秀的女兒視作眼中釘。
對他來說，女兒過分的優秀就是在自己的傷口上撒鹽，笨拙地對待親情的紅莉棲，一次次地引發了他內心深處潛藏的黑暗，最終，面對破壞了自己見面會的紅莉棲和岡部，他憤恨地取出了隨身攜帶的折疊刀。
難道說，居然是中鈸將紅莉棲殺死了嗎？本村哉志從未想到過世界上居然會有這樣的人渣父親，不但不要臉地竊據女兒的研究成果，還要殘忍地將自己的親生女兒殺害！
對此同樣感到憤怒的岡部在打斗中將中鈸摔倒，他手中的折疊刀也掉落在地上，岡部趕緊上前去撿，但是同時，中鈸也摸到了紅莉棲撞在貨柜上的時候掉落在地上的改錐，他拿起改錐帶著一臉憤恨逼向了紅莉棲。
在這種關鍵的時刻，岡部終于下定決心，將手中的折疊刀捅向了中鈸，但是仍舊尊敬著自己父親，小心翼翼地維持著親情的紅莉棲，卻在此時推開了中鈸。
“噗嗤！”
利器入體的聲音響起，在岡部震驚的目光中，他手中的折疊刀被他親手送入了自己最喜歡的女孩的身體里。少女滑膩的鮮血噴涌而出，染紅了他的雙手，濺射在岡部的白大褂上。
中鈸趁此機會拿起論文離開了現場，但是岡部卻沒有半點反應，只是難以置信地看著懷里自己最愛的少女。
面對在自己的懷里說著“不想死去”的紅莉棲，岡部發出了撕心裂肺的慘叫聲。
第一集中岡部聽到的慘叫聲，居然是他自己在這時候發出來的嗎？
本村哉志流著淚震撼地看著劇情如同完美的圓環逐漸彌合，第一次體會到了論壇上的大家所言的“神作”是什么意思。
回到了原來的時間線，岡部失魂落魄地跪倒在地上，α線的世界線收束居然讓自己親手殺死了紅莉棲，這個事實讓他無法接受，面對想要繼續行動的鈴羽，他只想放棄。
就在這時候，真由理手中的岡部的手機收到了一條新的郵件：“看電視”。
阿至一臉疑惑地通過手中的手機打開了電視，真由理在一旁驚訝地看到了在露西亞降落的中鈸博士手中的無涂裝金屬烏帕。
“不過還真是得救了啊！多虧了這個東西被金屬探測器發現，論文才沒有被燒掉。”
原來中鈸博士手中的那份來自紅莉棲的論文就是第三次世界大戰的起因，就是因為那份論文，大國之間才展開了激烈的時間機器開發競賽，最后演變成殺死了五十七億人的世界大戰。
而論文在飛機失事中被成功找到的原因，就是因為論文袋里的無涂裝金屬烏帕讓金屬探測器產生了反應。第一集里，就連真由理丟失的金屬烏帕，也是一個伏筆嗎？
可是這有什么用呢？岡部都已經要放棄了，得知了這一點就能夠改變紅莉棲的命運嗎？
就在岡部消沉地決定放棄的時候，在本村哉志驚訝的目光中，真由理上前給岡部狠狠地來了一巴掌。一向是溫柔可人的真由理，居然會用這種方式來讓岡部振奮精神，不說本村哉志了，就連被打了一巴掌的岡部也懵了。
“岡部可不是半途而廢的人哦，真由氏知道的，你是絕不會放棄的人！”
“真由氏無法向奶奶告別的時候，你也沒有放棄，每天都到墓地來，所以真由氏才能告別，所以真由氏才能振作起來哦，所以……不能放棄！”
聽了真由理發自肺腑的話語，岡部終于從親手殺死紅莉棲的死寂中清醒過來，看到了郵件中附錄的一條視頻。
2010年7月28日，岡部記起來那天自己從紅莉棲旁逃開后，屏幕那奇怪的花屏現象。
原來那個不是花屏，而是視頻未到特定的時間就無法被觀測。原來就連自己的這次失敗，也在未來的自己的預料之中！