北方的戰火只是局部沖突。
而大明的變化，讓劉元昭十分關注。
關寧軍幾次進攻北京城，而劉進忠也適時出兵攻打薊州。
而這時候京畿附近出現大疫，再加上旱災，及十萬大軍的補給十分困難。
崇禎顧不得許多，最終決議擁兵南下。
此時的河南又遇上了災荒，百姓民不聊生，可以吃的已經吃光了，最后只剩下吃人了。
李自成前年領兵幾千殺到商洛山，再次被官軍圍困，值此生死存亡之際，他提出了均田免賦的口號。
很快就在河南拉起了隊伍，百姓們紛紛高唱：“吃他娘，著他娘，吃著不夠有闖王。不當差，不納糧，大家快活過一場。”
李自成再度死灰復燃。
而張獻忠在崇禎十二年（1639年）五月，在谷城重舉義旗很快打垮守備谷城官軍，殺了縣令阮之鈿和巡按御史林銘球，拆毀城垣，劫庫縱囚。
明朝監軍道張大經和馬廷寶、徐起祚被迫投降。張獻忠離開谷城時，把官府上下大小官員向他索賄的名單、數字和時間，都詳細地寫在城內外的墻壁上，使百姓看清了明朝政治的腐朽。
張獻忠再起時，羅汝才、馬守應部也起而響應，并到谷城與張獻忠會合。
隱伏在商雒山中的李自成也重整旗鼓，經湖北鄖、均地區進入河南。農民起義的烽火，又一次在中原大地上燃燒起來。
熊文燦得知農民軍再起的消息，立即調左良玉和羅岱領兵追剿。
張獻忠將大軍埋伏在房縣以西的羅猴山，張網布陣，并派出一支隊伍佯攻敗退，引誘官軍入山，伏兵圍攻，官軍一萬多人全部潰散，羅岱被活捉，左良玉丟盔棄甲，伏鞍而逃，連軍符印信也丟失了。
崇禎帝一怒之下，撤了熊文燦的職，并予逮殺；左良玉降三級，帶罪隨軍立功。接著，改派大學士、兵部尚書楊嗣昌督師，總督以下并聽節制，再次展開對農民軍的大規模圍剿。
楊嗣昌一到襄陽，就拋出他策劃的“四正”、“六隅”、“十面張網”的戰略。
會師十萬，并檄河南、四川、陜西、鄖陽諸撫鎮將領，分扼沖要，主要任務是全力圍剿張獻忠和李自成。
起初，張獻忠不了解情況，接連失利，非常被動。后來通過情報摸清了官軍底細，張獻忠說服羅汝才，兩軍聯合，加強了農民軍的力量。
農民軍“以走制敵”、“避實擊虛”、出沒無常的戰術對付官軍。同時，張獻忠加強了情報工作，派出很多機靈的軍士扮成商人小販，四處探聽消息。
老百姓也常把官軍的動向告訴農民軍，還常給張獻忠的隊伍做向導。
因此，能及時掌握敵情，迅速采取軍事行動，打得官軍措手不及。然后迅速轉移，使官軍摸不清農民軍的去向，難以追擊。
官軍的主力部隊不是撲空，就是遭到埋伏而損兵折將。但是，農民軍被困在官軍的包圍圈里非常不利，隨時都有被圍殲的危險。
為此，張獻忠認為必須徹底粉碎官軍的圍剿計劃，跳出圈外去作戰，才能更有力地打擊官軍。
十三年閏正月，張獻忠在枸坪關被左良玉擊敗，率部突入四川。入川途中，在太平縣的瑪瑙山又受到鄭崇儉和左良玉的夾擊，傷亡慘重。
接著又受到湖廣軍、四川軍和陜西軍的追擊堵截，農民軍連受重創，退居興安歸州山中，又被左良玉等軍圍住，農民軍陷于困境。
為此，張獻忠利用楊嗣昌和左良玉的矛盾，派人攜重寶賄左良玉，說：“正是因為我的存在，朝廷才重用你，你的部下亂殺無辜，朝中早有人看在眼里，如果我不在了，那么離你死也不遠了。”
左良玉斗志松懈，張獻忠乘機收聚散亡，在山民的幫助下，走出興安，與羅汝才等部會合。
張獻忠又利用四川巡撫邵捷春和楊嗣昌之間的矛盾，集中兵力，猛攻邵捷春防守的新寧（今四川開江）。
邵捷春根本沒有想到農民軍如此神速，官軍一觸即潰。農民軍突破新寧防線后，順利地進入了四川。
農民軍的入川，打破了楊嗣昌的圍剿計劃，并在軍事上也從防御轉入了進攻。楊嗣昌剛愎自用，滿以為官軍已把張獻忠、羅汝才等部包圍在鄂、川、陜三省交界地區，勝利在握了。但實際上是面對軍令，從總督到將帥。再到士兵。幾乎是無人去執行。
張獻忠盡量避免與官軍打陣地戰，而采取“以走制敵”的策略，一晝夜能行三百余里，快速流動，常常把官軍搞得顧此失彼，腹背受敵，疲于奔命。
劉元昭看到了機會，農民軍復起，東北關寧軍叛亂，他覺得可以給崇禎再澆把火。
于是蟄伏多年，一直是偏師的西部軍團在劉元昭的命令下對著陜西發起了進攻。
陜西三邊總督鄭崇儉正領兵在四川與張獻忠作戰，陜西空虛，很快就全面陷落了，只剩下潼關在堅守。
鄭崇儉，字大章，山西鄉寧人。萬歷四十四年（1616年）進士。授河南府推官，歷濟南兵備副使。崇禎初，遷陜西右參政，累遷右僉都御史，巡撫寧夏，數敗套寇，因功獲賜銀幣，世蔭錦衣副千戶。
崇禎十二年正月，鄭崇儉升任兵部右侍郎，接替洪承疇總督陜西三邊軍務。五月，張獻忠在谷城起義，羅汝才等九營隨之俱反，興安（今陜西安康）告急。
總理熊文燦請求皇上命令鄖陽巡撫王鰲永防守江陵、遠安，陜西巡撫丁啟睿、四川巡撫邵捷春分別在各自區域內嚴兵防守，鄭崇儉主持提兵合擊。
這時，固原、臨洮、寧夏的三個總兵左光先、曹變蛟、馬科已跟隨洪承疇入衛京師，只有柴時華中途返回甘肅，鄭崇儉調用他而他卻不響應。
鄭崇儉于是傳檄要副將賀人龍、李國奇等從西安出兵。不料，李國奇的隊伍到略陽時發生士兵起哄，搶劫了瑞王的田租。
李國奇當時已提升為陜西總兵官，卻因此事被免去新職，而鄭崇儉也因之被貶官一級。
張獻忠起兵后，在房縣的羅英（犬字旁英）山大敗左良玉的部隊，策劃進入陜西。
鄭崇儉率領賀人龍、李國奇的部隊把他遏制在興安，于是起義軍回奔到位于湖廣、四川交界地帶的興山、太平。
這時，楊嗣昌已經以督師輔臣的名義領兵南下，到熊文燦的軍中取代了他的位置。
在此之前，兵部尚書傅宗龍建議讓鄭崇儉兼管四川的軍隊，而楊嗣昌已經發布檄文要求陜西的軍隊進入四川。
鄭崇儉于是在崇禎十三年（1640年）二月率領賀人龍、李國奇入蜀，會同左良玉在瑪瑙山（今四川萬源境內）大敗起義軍，斬獲首級一千三百三十三個，收降起義軍領袖二十五人，得到不計其數的兵器和馬騾。
雖然鄭崇儉親自指揮作戰而楊嗣昌遠在襄陽，但等到評定功績時，封賞的一半卻歸了楊嗣昌，鄭崇儉只升官一級，不過是恢復以前所降的那一級罷了。
張獻忠失敗后逃竄到柯家坪，四川將領張令在追擊他時被包圍。
鄭崇儉派兵打跑起義軍，賀人龍、李國奇等又一路追擊，在寒溪寺、鹽井擊敗起義軍，先后斬獲一千五百首級。
張獻忠的同伙“順天王”、“一條龍”、“一雙龍”全部投降。
鄭崇儉的軍隊五天內打了三次勝仗，威名大震。后他因為年老體衰請求辭官回家，而朝廷卻不同意，命令他率領鄭家棟回關中，留下賀人龍、李國奇繼續鎮壓起義軍。
陜西一出事，官軍大震，楊嗣昌更是失魂落魄。
不得已，明軍停止追擊張獻忠，鄭崇儉帶著賀人龍等人回守潼關。
陜西失守，明廷上下驚恐。
崇禎下定決心，往南遷都。
十三年五月，崇禎帶領文武百官南下，二十萬大軍跟隨，沿著京杭大運河直下揚州。
劉元昭得知消息，大喜，他大笑道：“可移都北京城也！”
留守京畿的明軍本就是老弱病殘居多，在華夏軍先鋒的猛攻之下，都退到了北京城里。
失去控制的北京城發生大疫，頓時成了一座活生生的地獄修羅場。
劉元昭率領大軍抵達之后，都不得不退避三舍，讓大軍對北京城進行清理。
這時候，部分華夏軍拿下占據天津，建設港口，而海軍則可以通過天津港口為華夏軍提供物資。
天津地區的形成始于隋朝大運河的開通。
唐中葉以后，天津成為南方糧、綢北運的水陸碼頭。
宋金時稱“直沽寨”，元朝改稱“海津鎮”，是軍事重鎮和漕糧轉運中心。
明永樂二年（1404年）筑城設衛，稱“天津衛”。
為了紀念開始發兵的“龍興之地”，朱棣把“直沽”這個曾的“天子渡河之地”賜名為天津。
“天”是天子的意思，而“津”是指渡口的意思。天津得到賜名后，于同年設置了軍事部門。
當時天津設有天津衛、天津左衛、天津右衛，統稱三衛。至今人們經常提到的“天津衛”一詞，就是從此而來。
永樂二年十二月九日（1405年1月9日）設天津左衛。永樂四年十一月八日（1406年12月18日）改青州右衛（一說青州左衛）為天津右衛。
處理北京城的瘟疫問題，花費了幾個月的時間，凡是得病的尸體都被燒毀。
而成內的房屋也只能燒掉，正好重建。
燒毀房屋只能一個區域一個區域的燒，免得大火失控，殃及池魚。
北京城建成后，曾多次面臨蒙古瓦剌部的入侵，1476年（成化十二年）提出在京城外加筑外城的建議。
1550年（嘉靖二十九年）開始修筑前三門外的關廂城（三座獨立于城門之外的小城），但由于需要拆毀的店鋪民房甚多，民情洶懼，工程不久即停止。
年（嘉靖三十二年）又決定利用元大都土城遺址，四面環繞修筑京城外郭城。
最初規劃的外城長七十里，東西十七里，南北十八里，設城門十一座、敵臺一百七十六座，西直門外和通惠河設置水閘兩處，其他低洼地帶設置水關八處。
由于工期浩大，在嚴嵩的建議下改為先修筑南面，將正陽門外的大片繁華市區包入，得到嘉靖帝的許可。
后因用兵頻繁，再加上1557年紫禁城大火災后將財力物力集中于宮殿的重建，因此外城一直沒有再筑。
1564年增筑外城各城門的甕城。嘉靖初年還在四郊新建了地壇、日壇、月壇。由此形成的北京城布局此后一直延續了近400年。
而劉元昭決定在燒毀大部分北京城房區之后，要將北京城外圍的城墻休整，將低洼濕地填平。
如此規劃，需要一大筆銀錢，目前的帝國支撐不起。
劉元昭只能暫緩計劃，讓工部細細規劃。
1640年，八月十日，上午時分，劉元昭進駐北京城，住進紫禁城里。
紫禁城，以三大殿為中心，占地面積72萬平方米，建筑面積約15萬平方米，有大小宮殿七十多座，房屋九千余間。
明成祖永樂四年（1406年）開始建設，以南京故宮為藍本營建，到永樂十八年（1420年）建成。
它是一座長方形城池，南北長961米，東西寬753米，四面圍有高10米的城墻，城外有寬52米的護城河。
紫禁城內的建筑分為外朝和內廷兩部分。外朝的中心為太和殿、中和殿、保和殿，統稱三大殿，是國家舉行大典禮的地方。
內廷的中心是乾清宮、交泰殿、坤寧宮，統稱后三宮，是皇帝和皇后居住的正宮。
看著紫禁城，劉元昭有些恍惚，以前是要買票的吧？現在作為自己的居所，心情很是激蕩。
劉元昭不由得仰頭大笑：“哈哈哈！崇禎是以為他還可以回到北京城來嗎？”
李明超連忙進言道：“崇禎肯定是癡心妄想，以陛下的文功武治，到時候連南京的紫禁城也給奪來。”
劉元昭大喜，說道：“讓人加緊準備，中秋節那天舉辦大慶典！倒是給城里百姓發點好吃的，每人一件新衣服！”
“陛下仁慈！”