然而時勢造英雄，僅僅過了三年，著名的鄭和船隊就開始了下西洋活動。他一眼看中了新興的馬六甲城，并在當地建立了明朝的第一個海外基地。這不僅僅是因為馬六甲本身有成為繁華港口的潛質，相對弱勢的地位也讓當地人更樂于迎接明朝官方勢力的介入。
鄭和也是出于雙重因素的考量，決心將這座看上去依然像是森林城市的小鎮，建設為大明王朝的黃金港，至于新加坡的存在，根本是不足為慮。
大明朝開始用大量的資源來營建馬六甲城，鄭和甚至親自在馬六甲當地建立了專門的倉庫與防御工事。馬六甲樂于也接受明朝人的扶持，逐漸擴大自己的勢力范圍。統治階層為了同印度洋來的阿拉伯商人親近，主動放棄了原先的印度教信仰，皈依了回教，但在外交上，一直緊跟明朝設置的朝貢貿易體系。
受此影響，馬六甲城與世界上所有靠貿易為主要營生手段的港口都不太一樣。諸如波斯灣地區的霍爾木茲島，同樣地域狹小，卻為了維護海洋貿易的主導權而需要維持一支規模不小的艦隊。地中海上的威尼斯與熱那亞，則更是用有限的人口，供養著名列前茅的海軍力量。唯獨東方的馬六甲城，對于建設海上力量很不上心。相反，馬六甲蘇丹會依靠從孟加拉和爪哇等地招募的雇傭軍，建立了一支較為強大的陸軍。
畢竟，本地蘇丹一直將目光放在身后的馬來半島，他們依靠大明朝廷的支持，與企圖南下的泰國人一決高下。在明朝終止了下西洋航行后，當地的統治者仍舊堅持定期的朝貢，并依靠大明王朝的巨大體量來獲得的保護，如果不是明朝軍隊在朱棣時代就從越南撤軍，兩者之間都可能建立起貫穿中南半島的官道。
也是在這個馬六甲蒸蒸日上的時代，新加坡的地位一落千丈。作為一個并無強權保護的自由港，很快就落入了馬六甲蘇丹國的控制。蘇丹總是將資源聚集到自己的王城，而打壓和削弱其他港口的重要性。新加坡島上原本一直存在的定居點，就在馬六甲人的統治時期，逐漸被廢棄殆盡。
非常諷刺的是，馬六甲的統治者在不久之后又被迫開始復興新加坡。
1511年，葡萄牙大征服者阿爾布克爾克兵臨馬來亞，馬六甲城被人數不足二千人的遠征軍占領。蘇丹及大部分上層都逃出城市，在北面的馬來亞內地重組了柔佛蘇丹國。他們曾經派出使節向明朝求援，卻發現自己根本不是北京朝廷的關心所在。
由于自己手里最能吸金的港口喪失，新的柔佛蘇丹只能嘗試在新加坡重建港口和定居點。但這個重新建立起來的小港口，根本無法同依靠榨取地區內大部分資源建設的馬六甲相比。繼承了前人壟斷傳統的葡萄牙人，也根本不會允許新加坡的再起。所以柔佛人自己也對復興新加坡的計劃非常猶豫。只要覺得有機會，他們就會向葡屬馬六甲發起反攻。絲毫沒有考慮過如何營建新加坡。
到了這十幾年后，荷蘭人開始染指南洋地區，柔佛蘇丹看到了驅逐葡萄牙勢力的希望，數次同荷蘭艦隊聯合圍攻馬六甲的要塞，然而，荷蘭人的最終目的是控制更南方的香料群島，所以不可能一直將兵力浪費在北方的馬六甲，結果，憤怒的葡萄牙人在1613年進攻新加坡島，將緩慢復興中的定居點摧毀。新加坡也就進入了歷史上的第二個黑暗時期。
荷蘭東印度公司是地區最強的小強，一直給葡萄牙人以強大的壓力，但僅此而己，他們此時的戰略重心已經轉移到了南方的總部巴達維亞，沒有選擇之下，柔佛人只好繼續的治理新加坡了。
新加坡在柔佛蘇丹治下又開始了新一輪的復興，但只要馬六甲的核心地位還在，新加坡就永無出頭之日。
但是到現在又出現了轉機，米柱決定大舉南下，新加坡是他計劃之中重要的一環。
作為新一代的海水霸主，大明在很多方面都超越了此前的葡萄牙與荷蘭，西洋人很難往安達曼海以東投放上萬的人的力量，大明卻是沒有這方面的限制，大明更近，而且土地兼并嚴重，人口過剩。
在原版里，在未來的這幾十年之中，小冰河期危機全面爆發，大明因為戰亂、天災、人禍死了幾千萬人，山河為之變色，如果將這些人移民往南洋，這真是一舉多得。
國內解決了人口危機，國外則是解決了在南洋人口少的問題。
由于近現代船舶的體積與吃水都日益增大，很多古代的優良港口，開始變得不適合海船停靠，海運貿易的數量級增漲，也對港口的吞吐能力有了更高的要求。門朝大海的新加坡深水港，就在這些方面上，遠遠勝過了只有狹窄河道的馬六甲城。
而古代航海家所喜愛的柔佛海峽，也繼續為小船提了供屬于自己的臨時避風港，僅從這點來看，馬六甲就已經不再具備同新加坡做競爭的實力。
同樣，就軍事方面的用途而言，新加坡的意義也遠超馬六甲。
米柱的南洋戰略，是要在這里打造一個新國度，他們最強大的就是水師，以后也將成為一個縱橫七海的超級海上強權，分布全球主要沿海經濟區的利益維系，都需要強大海軍的隨時抵達。新加坡的深水港，自然是戰艦經常光顧的寶地，無論是北上大明，南下爪哇、東入呂宋、日本，西進印度洋，都是一中心之地，所以有鑒于此，米柱便決定在新加坡打造一個超級軍港。
李旦駐驊于此，是準備前期的工作了。
柔佛人將新加坡叫蒲羅，是馬來語之對音。“蒲羅中”是新加坡島最古老的名稱，意為“馬來半島末端的島嶼”，這比淡馬錫（大明朝把新加坡稱作淡馬錫）早一千多年。
1320年，元朝派人到一個叫龍牙門的地方尋找大象，這就指的是吉寶海港，1330年前后，一名叫汪大淵的中國人到來，稱這個居留地為“龍頭”，并說已經有華夏人在此居住。最早把新加坡叫做淡馬錫（或海城）的稱謂出現于1365年的《爪哇史頌》。
而新加坡之說也出于同時期，傳聞公元十四世紀有一位“室利佛逝王國”的王子，前往馬六甲途中經過新加坡，在上岸時看到了一只神奇的野獸，下人告訴他那是一頭獅子。而這位王子就非常霸道的把這片土地命名為獅城，而梵文中獅城的發言就是新加坡。
米柱很有偉人領袖的氣質，他在地圖上一指，在這一塊劃了一個圈，然后命名為新家坡。這既繼承了他應有的歷史文化傳承，又有新的含義。
以后會有一個新的歷史名詞，叫大明填南洋。
指的是大明帝國第十五代皇帝康熙皇帝在位的七十四年間，在國家和官府的組織之下，源源不斷往南洋移民，在長達七十年的移民史中，大明向南洋遷移了上千萬人口，大大緩解了本土的人口危機，并在南洋形成一個新的帝國，叫南洋帝國。
大明帝國通過船只，源源不斷的將人口運往南洋。
這些移民他們大多以青壯為主，他們懷著美好的愿望，飄洋過海，前往南洋追求新的生活，新加坡則是他們穿過南大明海抵達陸地的第一站，無論是繼續南下爪哇、澳洲，西進印度洋，這里都是中轉站，他們在這里休息，補充物資。
當他們在新家扎根，取得成就，回大明探親祭祖之時，新家坡也是中轉站，這就讓之成為了一個包含有特殊意義和情懷的地方。
新家坡的土地面積是六百平方公里，（后世新加坡七百多公里，主要是填海多了一百公里），海岸線總長200余公里，不過內地一府之地大小，由新家坡島、圣約翰島、龜嶼、圣淘沙、姐妹島、炯島等六十余島嶼組成，最大的三個外島為裕廊島、德光島和烏敏島。
新家坡地勢起伏和緩，其西部和中部地區由丘陵地構成，大多數被樹林復蓋，東部以及沿海地帶都是平原，地理最高點的武吉知馬山，高也才163米。
在海島生活，淡水為第一要素，沒有淡水，在這時代直接被判定為不適合人類居住之地，新加坡河流由于地形所限，都頗為短小，全島共有32條主要河流，河流有克蘭芝河、榜鵝河、實龍崗河等，最長的河道則是加冷河，這些河流都改造成蓄水池為居民提供飲用水源。
新家坡的氣候也很好，因為新家坡地處赤道附近，一年四季氣候差別很小，年平均溫度在與大明夏秋之間相近，不會有酷熱，也不會有奇寒，這讓在北京大半年穿著厚厚衣服，冬天更是將自己裹成棕子一樣的米柱欣喜不己，就這里了，新家坡就是他末來十年的奮斗之地，未及出發，他己委托李旦，為他覓一風水景色佳處，建筑他的伯爵府。