左第一手持般若智焰，表燃燒一切苦惱；左第二手持三叉戟，藏名卡章嘎，代表盡攝三界空行母。
原本二手合掌持單面小普巴杵，表凈除一切煩惱魔障。
普巴杵有二種：單面普巴表示若國之地方政府，受灌頂的人可以隨身攜帶，用以護身。
三面普巴如國之中央政府，修法時可供在壇城中，修持好的人才可以隨身攜帶。
擁抱淺藍色空行母，名口洛給丁媽。
右手持烏巴拉花。
本尊佛母有二：一名洛給登媽，是喜樂相；二名阿頌媽，為忿怒相。
本法尊所抱為第一位佛母，佛母右倚之卡章嘎即表第二位佛母阿頌媽，繞本尊背后，左手嘎巴拉腰圍豹板裙。
另說，佛母名洛格津母（柯洛潔蝶），身淺藍，右執烏巴拉花(亦有傳承持天杖者)，左擎盈血顱器，五手印飾，腰系豹皮裙，與父佛現雙運大樂相。
本尊腳下為蓮花，花上月輪，其上有日輪。
背后生出翅膀，像非常銳利的劍。
四腿，右弓左伸，右二腳踩二男魔之背；左二腳踩二女魔之胸，表降服四魔，安住于般若智焰之中。
男為代表死神，亦象征七情六欲；女魔為代表與生俱來之嗔癡，亦象征比較特殊之不良嗜好與習氣。
本尊具足降服此四魔的能力。
普巴金剛身著皮衣：第一象皮大披肩，表降服癡。
藏人認為象是最愚癡的動物。
第二人皮衣腰帶，表降服貪，因為人是最貪之動物。
第三虎皮圍裙，表降服嗔，因為虎之嗔心最重。
頭戴五骷髏冠，表五佛五智；頸上掛有三串人頭項鏈、骨飾、蛇飾莊嚴，代表本尊具足降服龍族，能統治一切之威力。
觀想普巴金剛前額有一月輪，上有白色“嗡”字；喉間有一蓮花，上有紅色“阿”字；心間有一日輪，上有藍色“吽”字。
普巴金剛站于廣大的智能火焰里，如彩虹的幻化身，而非實體。
似水中月、鏡中影。
次觀本尊心中有一小白蓮花，其上有月輪，輪上有日輪，中間有一如大拇指的第一節大小的白色雙身金剛薩埵。
金剛薩埵心中有一如米粒大的金質五股杵，杵臍有一非常小的金色日輪，日輪上有藍黑色“吽”字，外有咒輪向左排列圍繞（反時針方向），發出金黃色光芒。
持咒時，咒輪順時針方向旋動，放光遍布全身，再遍照三千大千世界諸佛國土，供養諸佛，同時諸佛亦放光加持遍滿法界，消除一切眾生的惡業，一切眾生接受加持后，皆轉成普巴金剛，一切聲音皆成普巴本尊咒語，一切宇宙皆成本尊凈土。
當念完一串念珠后，觀想所有本尊融入自身，次融入金剛薩埵，再融入咒輪，最后融入“吽”字，“吽”字從下往上，收入圓點，圓點像彩虹消失虛空中，即于此無念無相住空性而入定，愈久愈好，此即是大圓滿境界。
剎那間如魚躍深淵，化現普巴身相，大悲遍滿。
如水中月、鏡中影、水上漚、空谷向、八幻喻或十二幻喻凈化身。
此即大圓滿中的大圓滿，普字就是空性的意思，巴字就是智能的意思，普巴就是空性與智能結合，成不二的體性。
普巴金剛的壇城是諸佛的總相，三寶的總集。
普巴法的修持，在于斷除一切自我之貪執，消除內心之恐懼，如此，才能了解法界性，亦即不在于降伏外在之物，而是在于對自己內心本性的了悟。
密宗，歸根究底，是對于咒語的修習，講究身口意三密相應，就是修行的時候，嘴里面要念誦咒語，手上要結手印，有的法門對于身體的姿勢還有一定要求，然后最后是腦中要觀想，有的觀想憤怒本尊，有的觀想種子字，也有的觀想金剛杵之類的法器。
前面所提到的便是身口意三密相應的修習法門，但對于初學之人，也可以修習簡軌，也就是只有口中念誦咒語，沒有手印和觀想。
元一前世曾經受薩迦巴上師指點，學習過幾個普巴金剛的儀軌。
最簡單的一個儀軌，便是先皈依發心：諸佛正法賢圣僧，直至菩提永皈依，以我所修諸善根，為利眾生愿成佛。
然后念誦普巴金剛祈請頌：無量熾燃末劫火，鎮踏雄魔座墊上，勇士金剛孺童佛，伏魔十尊飲血眷，祈請普巴海會眾。
接下是咒語：嗡班扎格里格拉雅薩瓦目念旺吽呸。
最后則是回向文：文殊師利勇猛智，普賢慧行亦復然，我今回向諸善根，隨彼一切常修學。三世諸佛所稱嘆，如是最勝諸大愿，我今回向諸善根，為得普賢殊勝行。愿我臨欲命終時，盡除一切諸障礙，面見彼佛阿彌陀，即得往生安樂剎。
然后就是普巴意集心明點——事業密修儀軌，所謂的事業儀軌，就是成就種種事業的儀軌，例如求財求姻緣求長壽。
首先要皈依發心：那摩。殊勝三寶普巴本尊眾，皈依并且發起菩提心。無明魔障解脫法身中，本基無有遷轉舞殿界，見地本面自臉親見禮，事業普巴海會請降臨，現有一切普賢供養云。
然后是正行：啊。自心離戲超意元始性，識覺無滅吽字光聚散，顯現自性金剛大童子，藍黑九首十八手臂者，金剛翅膀翱翔遍虛空，下身天鐵普巴三尖銳，刺破魔類敵障妖鬼心，空性自顯大輪封印繞，四覺十憤塔超眷屬眾，顯而無自性如水中月，明空雙運清楚作觀想。吽舍。如來佛子金剛普巴尊，事業度眾界中請降臨，自升自解堅固恒安住，一味法身親見而頂禮，現有廣大等凈獻供養，事業廣圓本尊前頂禮，心間天鐵普巴房中央，吽字周圍環繞心咒語。
隨后是普巴咒語：嗡班雜格里格拉雅薩瓦幕格南邦吽呸。
然后要八供咒：啊剛。
最后回向文：金剛孺童圣眾頂禮贊，普巴意集修習賜加持，清凈眾生罪業資糧圓，事業無別二利獲究竟。