陳燮離開內閣，也是和文官商量好的妥協結果。任期之內，陳燮除了制定法律，推動改革之外，還要推動立法，確立海外的爪哇、婆羅洲、澳大利亞、夏威夷等實際占據的領地作為大明一部分。任期結束后，陳燮將離開大明，出任大明聯邦海外大總統一職。實際上確立了陳燮近似海外開國的地位，海外聯邦將以憲法的形式確立，其領土永遠是大明的一部分。本質上，海外聯邦是大明的加盟國。
建新六年秋，大明進入了一個新的時代。這個新時代的最大特性，就是保留了皇權，并且以憲法的形式確立了皇權的合法性，而不是過去那套“奉天承運”。作為一個特色的立憲變種，大明保留了貴族階級已經相應的特權。說起特權這個東西，任何體制下都不可避免，更不要說在大明了。
新的時代本質上還是把整個大明的人分出了兩個階級，統治階級的組成有傳統的皇族、勛貴、文官集團、士紳、新興的資本家組成，其余的全部都是“民”。兩個階級唯一相同的地方，體現在稅收法律上。就算是皇帝的產業，也要交稅，這一條太牛逼了。把整個大明都搞的一點脾氣都沒有。看見了吧？皇帝都得交稅，你算個蛋蛋。
要的就是這個效果！真正的特權隱藏在法律的字面之下。國會成員的參選權、選舉權，用法律的形式規定，每年納稅不少于五十銀圓者才有選舉資格，參選者每年納稅不少于三百銀圓。就這兩條出來，就斷了多少人參政議政的念想。其次是另外一個渠道。就是公務員的科舉，你得是學霸，還得在實際工作中成績混個中上，才有資格繼續你的仕途之路。
想要投身政治，這兩條路只能二選一，要么你有錢，用交稅說話，要么你是學霸實干，用能力說話。雖然政府依舊掌握了官員的任免權利。吏部依舊是個熱的燙手的衙門，但是今非昔比了，任何一個官員在任職期間，當地議會都會提交一份報告，綜合評價這個官員的政績。這份報告，對官員的前途有極大的影響。這就是議會手里的大殺器！好聽一點叫監督政府，難聽一點叫拿著顯微鏡找官員的麻煩。
確立了權利和義務之后，接下來的就是政府機構改革了。首先改革的就是禮部。過去的禮部太混沌了，胡子眉毛一把抓。權責不明。改革首當其沖就是禮部，首先保留了禮部這個稱謂，但是其職能變得非常單一，就管一些禮儀上的事情。祭祀、祭天之類的儀式，都歸禮部管。其他的只能部門被分離出來，增加理藩部、教育部這兩個部門。第二個改革的部門是刑部。分割成檢察部、警察部。一個負責查案，一個負責審核批捕。工部分成了工業部、格物部（科技部）、水利部，本來還打算城里一個地質部，結果一想土地礦山都是私人的，就算是公家的最終也是由私人去開發。就不用多出這么一個部門浪費公帑了。都察院、大理寺被取消，以部門納入皇帝直屬的宣傳部，這是朱慈烺為自己爭取的一個重要的砝碼。有了這個部門在手里，今后辦個報紙就得由宣傳部門批準不說，你還得交管理費。就這個部門，還是國家出錢養著，皇權不能什么都落不下吧？對于這個事情，陳燮沒堅持，他要就給他了。反正今后跟皇帝較勁是的建新政府，陳燮呆不了多久，五年就得閃人。在一個就是大理寺，直接取消了，審案今后是法院的事情，立案、查案是警察的事情，核準、批捕、搜查令是檢察院的事情，還留著這么一個機構干啥？同時被取消的部門還有六科，這玩意就是給皇帝掌握權力做助手的，也可以取消了。不過這個部門不是真的取消，而是改頭換面，以內閣秘書處的名頭粉墨登場，說穿了就是給內閣大佬做秘書吧。以前是給皇帝打下手，換東家而已。
吏部的變化不大，甚至連名字都沒變，變化的是內部的職能和結構，一定程度的人員精簡是必須的，新的體制下，吏部用不了那么多人了。就是根據各地議會和地方官員的報告，派人去核實一下之后，分配縣以上的官員位子。這個權利，打死吏部上下都不會放手的。
兵部的改革最為慘烈，八成以上的文官被踢出了這個體系，兵部的名稱都被取消了，直接設總參謀部，海軍部、陸軍部，三個部門等級平行，實際上掌握權力的是總參。任何師級（少將）以上的調動和任免，都必須由總參批準。調動一兵一卒，必須有參謀簽字才能執行。
戶部的改革放在了最后，這部門真不好太早動，不然各種事情不能正常的撥款，都得亂套。這個部門改起來事情最多，首先是增加一個財政部，所有軍政部門撥款，都從這里出。其次增加一個統計局，用各種數據說話，兼職查賬。廉政公署要查賬，都得請他們出馬配合。最后是分割出來一個稅務部和國土部。這個兩個部門一個負責收稅，一個負責管理國家土地資源。分割出來的四個部門，別看財政部牛叉吧。真正牛叉的其實是稅務部，所有的人員都是精銳不說，待遇都比別的部門要高一些。為什么這么安排，因為這是大家的錢袋子的來源啊。陳燮對別的部門改革都不很上心，但是對稅務部的組建，則是每個細節都去盯著看。力爭把這個部門建設成鬼見愁，是個人被查出來偷稅漏稅，都得讓他恨爹媽把自己生出來才行。石頭里都得榨出油水，稅務法細致的讓人看著頭皮都發麻。偷漏稅的懲罰必須讓敢這么做的人傾家蕩產。最牛叉的是稅務部是有武裝的，船舶司改名海關之后，下面的偵緝隊都是稅務部管。各級稅務部門也設有偵緝隊，敢于暴力抗稅，堅決武裝鎮壓。
六部改革之后，剩下一個比較牛叉的部門一直沒去碰，這個部門就是翰林院。以前是專門給皇帝做秘書的，后來的大學士都從這里出來。現在這個翰林院，則變成了一個“中央黨校”之類的機構，平時是個清閑的部門，修史、編書。你要不在這個部門里呆過，你就沒資格出任侍郎以上的職務，更別提入閣了。總而言之，這里就是內閣的搖籃。
京師的改革過程很復雜，等到六部都改革完畢，新的部門架子都搭起來了，就等往里頭填補人員的時候，吏部就成了轉陀螺了，最忙的就是他們了，但是最嗨的也是吏部。取消后的南京六部尚書侍郎，一大堆人都蠢蠢欲動，找到了重新愛崗敬業的動力。
這一次機構改革，前后持續了整整一年，主要負責的還是現任內閣，陳燮不過是簡單的看看，重點盯著兵部改革和稅務部建設。多出來的尚書、侍郎的位置，變成了一場盛宴。
新的內閣在各部門的改革完成之后，最終確定了內閣的模式。以前是廷推產生內閣，現在不是這么干了。所有符合閣臣條件者，都可以參選首相一職。在哪里選？在國會！拿什么選？施政報告！你要當首相，資格也足夠，沒問題，你去國會報名備案，然后去影響國會議員支持你給你投票。只要你的施政報告贊成率過三成，就能進入下一輪的選舉。選舉分兩輪，最終能不能當選，還得看下院的投票結果，不過半數就重新選。
兜了一個大圈子，最終大家才發現，國會才是老大。議長陳燮雖然看似不在內閣了，但是想做首相，你還得抬頭仰望一下他的尊榮。這樣一個結果，文官集團就算不滿，也不敢吭氣。因為很簡單，國會成員的組成太兇殘了。傳統的勛貴有了這個權利，嘴巴都笑裂開了，你想奪走么？那不跟你玩命啊？下院的成員就更兇殘了，都是從基層的議會殺出來的好漢，有錢是最基礎的條件，有民望是第二個基礎。這幫國會議員，隨便哪一個，在各自的省份都是跺跺腳就地震的主。更不要說那些新興資本家了，他們屬于嗜血一類的物種。要不怎么說資本從誕生的那一天起，每一個毛孔都留著血和骯臟的東西呢？資本家要有好東西，這世界早就和平進入了。
當選首相之后，才是組閣。這個時候首相就牛叉了，除去皇帝直屬的廉政公署和宣傳部，其余部門的首腦，都由首相從合格的人里頭任命。這才是首相最吸引人的地方，權利太大了。一個首相，其余各部的尚書任職后自動入閣，這就是新的內閣組成形式。
憲法賦予首相的權利很大(