咸豐皇帝在人事權上面很有一套，既然江西地方官員極力彈劾湘軍。而湘軍也需要江西地方上的錢糧支持，那咸豐皇帝就讓湘軍暫時聽命于江西地方官員。湘軍作為客軍的時候，江西地方官員還能以各種理由拒絕向湘軍提供糧草供應。現在湘軍聽命于江西地方官員，那江西地方就沒理由拒絕提供糧餉給“自己的軍隊”。
在曾國藩離開之后，湘軍名義上的最高領導者就成了胡林翼。不過這最高領導者更多的只是一種說法或者是恭維。湘軍采取的是兵為將有的制度，各個營官掌握著兵權，他們不聽話，誰也沒辦法。而咸豐則命胡林翼帶兵盡快順流而下攻打江寧。
在湘軍的軍事會議上，胡林翼拿出了曾國藩提出的戰略，“想剿滅粵匪，需從石達開、洪逆、韋澤，這么一個次序入手。切不可同時與之開戰。”
“大人，江西局面都到了那個模樣，已經不可能在江西打仗了！”此次在攻下九江的戰役中立下大功的李繼斌說道。
胡林翼的手下紛紛表示贊同，咸豐皇帝的確讓湘軍聽江西指揮，可這種做法說白了就是糊弄人的權術，湘軍不認，江西官員更不會認。所以該不提供糧草的，還是不提供糧草。該搶掠江西地方的，照樣搶掠江西地方。這種情況下，想在江西作戰就需要自帶干糧。此時胡林翼的部隊剛打完大仗，立刻就去江西參加圍攻石達開的戰役，這要求明顯不靠譜。
經過一番爭論之后，胡林翼的手下都認為，此時最需要的是帶兵回武漢休整。休整幾個月之后，部隊從長江以北進發，先伙同淮北的江忠源一起攻下淮南，然后與湘軍水師配合，共同拿下安慶。那時候湘軍就能順流而下，直撲江寧，消滅太平天國。
這戰略倒是看著有可行之處，首先就是部隊可以避開被湘軍折騰的稀爛的贛北地區。胡林翼身為湖北巡撫，掌握著湘軍眼下最大的糧草與兵源的供應地。從湖北的角度出發，湘軍應該直接從湖北進軍安徽，而不是舍近求遠跑去江西作戰。
此時湘軍也知道了光復軍進入江西作戰的事情，他們就更不想去江西打仗了。若是打著打著，突然遭到光復軍從背后發動的進攻，誰能受得了這個。而且有了攻克九江的經驗，胡林翼手下的湘軍對戰勝太平軍頗有信心。而且胡林翼本人雖然與曾國藩關系不錯，但是他手下的湘軍將領無疑更喜歡湘軍的祖師爺江忠源。去長江以北作戰，讓符合了大伙的期待。
胡林翼固然還是很注重曾國藩的觀點，但是他也不可能完全不管部下的態度，強行推行他的想法。加上部下們此時首先要求回湖北休整，胡林翼最后只能同意部下的請求。
到了八月初，太平軍發現湘軍攻克九江之后沒有繼續發動進攻之后，終于有點放下心來。此時部隊整編已經完畢，五軍主將以及副將們紛紛到位。盡管失去了石達開帶領的十幾萬西征軍，太平天國的守城部隊以及野戰軍加起來不到十五萬。其中野戰軍總數不過六萬余人。
但是任何事情都有兩面性，沒有了那些三心二意的人，天國剩下的這些將領未必忠于天王，卻都忠于天國。此時洪天王也就是在天京城里頭作威作福，大家也懶得與這位名聲已經稀爛的天王計較。這項艱難的工作自然有五軍主將之首的林鳳祥負責。五軍主將只需要根據戰場局面的變化，做出相應的舉措即可。也就是說，五軍主將開個會，就能決定這些固守天國外圍軍區的行動。這些軍事行動無須接受天王洪秀全的干涉。
九江失守，損失了名將林啟榮以及兩萬精銳兄弟，這的確令人遺憾。可韋澤送來了150門青銅炮，還留下了鑄造炮彈，訓練炮兵的說明書。其實不用這些在太平天國的兄弟眼中“額外”的饋贈。這150門大炮帶輪子的炮架就讓林鳳祥喜出望外。親自試過之后，林鳳祥發現這些火炮能夠隨軍行動，遇到難走的道路之時甚至可以拆卸開來，用馬匹或者人力運輸。其速度不會比部隊行軍慢。這完全解決了困擾林鳳祥很久的火炮問題。
當然，林鳳祥的部下還喜滋滋的向林鳳祥表功，這次沒給韋澤剩余的火炮款項，為林鳳祥省下了幾萬兩銀子。這件事讓林鳳祥大怒，韋澤可不是林鳳祥他們能夠得罪起的人物。誰知道以后林鳳祥還有什么事情要求到韋澤那里的，這次沒給錢的事情可就是韋澤拒絕以后林鳳祥請求的最佳理由。
可除了痛罵屬下之外，算命先生出身的林鳳祥也知道此次的事情已經無法善了。若是韋澤真心想和林鳳祥繼續打交道的話，他的部隊也不會那么輕松的不管不問，直接撤軍回廣東。韋澤那邊看來也沒有什么繼續合作的強烈愿望。林鳳祥只能對自己說，暫時先滿足于得到這些火炮的“意外之財”好了。
此時江西，常州，皖南三個方向暫時平靜下來。太平天國長江以北的兩個方向就顯得熱鬧起來。第一個方向自然是清軍江南江北大營中江北大營那部分清軍渡江，在江蘇長江以北地區重建了江北大營。當然，這個江北大營距離原先的江北大營未免太遠。可這也是清軍反擊的信號。
第二個方向則是江忠源帶領的淮軍，他們一直派兵頑強的進攻壽州，并且對已經開始松動的淮河防線進行滲透。自打1853年韋澤駐扎安慶，以安慶為據點開始占據安徽之后，太平天國的北方防線還從來沒有感受過如此巨大的壓力。
所以五軍主將的軍事會議召開地就設在安徽巢湖。這里一直是太平軍糧草供應中心。在會議上，五軍主將都認同了林鳳祥提出的建議，“分化石達開與楊輔清的聯軍，盡可能先拉人回來！”