由于要封鎖巽他海峽保護通往爪哇本島的海上交通線，因此東天竺水師實際上是處于分兵狀態，前往薩武海護航的分遣隊只有六個巡洋艦分隊、四個巡航船分隊總計二十八條戰艦和二十四艘信報船，可謂力量有限。
幸好荷軍爪哇艦隊的實力也不強，算上接收蘇拉威西海海戰幸存的兩艘四十門炮戰艦及三艘武裝商船在內，荷軍主力戰艦也不過與夏軍一樣只有二十八艘，只是武裝商船的數量多達三十四艘，比夏軍信報船多出十艘，略占優勢，但關鍵的戰列線炮船的數目卻不足夏軍巡洋艦的三分之二，因此雙方實際上是勢均力敵。
既然是勢均力敵，戰斗就相當的激勵。荷軍固然是沒有退路，夏軍也不想讓同僚專美于前，雙方都打出了自己現階段最佳的水平，到處都是沖天的水柱和濃烈的硝煙，整個大海仿佛印度神話中被天神和阿修羅攪翻的乳海一樣，充滿了致命的威脅。
從蘇拉威西海海戰幸存者口中得知夏軍戰術的蘭德生中將很快將整個艦隊分成戰艦隊和輔助艦隊兩部，分別迎戰夏軍，希望能在己方主力牽制夏軍主力的同時，先利用優勢的輔助艦隊獲得勝利。然而蘭德生中將顯然沒有想到，盡管荷軍武裝商船一度以數量壓制了夏軍信報船，但夏軍依舊憑著遠較荷軍武裝商船堅固的船體及較快的船速與荷軍周旋。因此，荷軍武裝商船一時無法占到真正的上風。
戰到當日未時三刻，荷軍三十四艘武裝商船中沉沒了七艘、焚毀了六艘，另有四艘重創，船上水手傷亡更是超過千人；夏軍方面也有十四艘信報船損毀沉沒、近九百余名水手傷亡；可以說，雙方都是血流成河。
雙方輕型船只不分高低還在繼續纏斗，主力戰船隊的交手卻有了結果。
截止到當天酉時初刻，夏軍主力艦隊共損失四等巡洋艦一艘、巡航船六艘，另有一艘三等巡洋艦和四艘巡航船重創，二千一百余名官兵傷亡；荷軍方面則損失二艘戰列線炮船和四艘小型戰艦，另有一艘戰列線炮船和七艘小型戰艦重創，傷亡水手二千四百余名。
就交換比來看，雙方也只能說不分勝負，然而荷軍戰列線炮船數目有限，損失三艘等于損失了三分之一強的戰力，而夏軍損失兩艘巡洋艦后依舊還有十艘可戰，因此于大局無損；而且在巴達維亞、泗水等重要港口或失陷或被封鎖后，荷軍受創船只無法大修，損失幾乎無法彌補；因此，從戰略上來看，荷軍已經徹底失敗。
好在此時太陽已經落于海平面以下，雙方無法繼續交戰，蘭德生中將這才借著夜色，得以脫身。至于損失同樣嚴重的夏軍一時也無力繼續追擊，只是派出一艘狀況尚且可以的巡航船向巽他海峽一線的水師主力報告狀況，其余能就地修理的就地修理，不能就地修理的，只好蹣跚的帶著傷員直接開往葡屬帝汶島休整。想來，墻頭草的葡萄牙人絕不敢向拒絕荷蘭人一樣，拒絕夏軍水師的進駐。
說實在的，仗打到這個份上，聯合東印度公司距離徹底失敗已經只有一步之遙了。只是荷蘭人不敢服輸，因為一旦服輸，整個聯合東印度公司就必然遭到破產的滅頂之災，所以只能咬牙堅持下去，尋求一絲可能翻盤的機會。
可惜，翻盤的機會沒有出現，致命一擊卻接踵而來得知薩武海海戰結果的常天遠在惱羞成怒之余果斷率領西線護航艦隊越過巽他海峽直撲芝拉扎，一舉將剛剛進港的荷蘭爪哇艦隊堵在港內。雖然蘭德生海軍中將幾次冒險組織艦隊突圍，但始終被夏軍堵在港內，反而因此損失了兩艘戰列線炮船和六艘武裝商船。
無法突圍的荷軍艦隊只好借助有限的岸防炮火來擋住夏軍，希圖藉此保住港內船只，如果，出于保存軍艦的考慮，常天遠并沒有直接炮擊港口。但荷蘭人拖延的戰術很快隨著夏軍火箭船的到來變成了泡影夏軍火箭雖然很難對付純石質建筑，但對付木頭船卻是極大的殺傷力在一場暢快淋漓的焰火表演后，荷軍剩余艦船全部爆炸起火，連帶芝拉扎港的碼頭及港口設施一起化為了灰燼。
盡管夏軍沒有進一步派遣水兵登陸，但在盛大的煙火秀之后，蘭德生將軍及荷軍上下的抵抗意志悉數瓦解。在夏軍勸降使節同意保證不對投降者進行殺戮的條件下，蘭德生將軍以下殘余的九百余名荷軍水手和八百多荷軍港塞守備部隊毫不猶豫的向常天遠投降。隨后被俘的蘭德生中將被運回巴達維亞，代表華夏再次向城內評議會、總督勸降。
香料群島艦隊和爪哇艦隊相繼滅亡的消息如晴天霹靂一樣震驚了整個巴達維亞，這可是整整一百二十條船呢，整個聯合東印度公司不過兩百艘而已，如今百分之六十化為烏有了，即便能保住東印度群島，聯合東印度公司的破產也就在眼前了，更何況，丟了艦隊以后，外援中斷，各地要塞已經不可能堅持下去了。
有了這樣的明悟，在如喪考妣的同時，上層人物不得不考慮自己的將來了。破產當然是可怕的，但那是公司的財產，也就是十七人委員會的財產，并非是自己的，丟了自然不可惜。而且破產也不是最可怕的，可怕的是破產后沒有東山再起的機會，那就是徹底沉淪了。既然有了這樣的想法，眾人考慮的更多的是如何保全自己的生命，以便日后能卷土重來。
保全性命自然只能投降了，于是華夏武成十六年（西歷1714年）六月初七，巴達維亞總督和評議會以保全個人財產為由，向華夏提出投降的先決條件。對此，已經從凌牙門趕到巴達維亞的大都護林耕斷然拒絕，只允許每個荷蘭人保留三百荷蘭盾的財產，其余一律作為華夏軍費的賠償，同時要求巴達維亞評議會答應將細蘭全島和東印度普利卡特、薩德拉斯的商業據點以及荷屬澳大利亞全部交出。
巴達維亞評議會認為丟了東印度群島之后，斯里蘭卡和普利卡特、薩德拉斯以及荷屬澳大利亞一樣保不住，可以將上述四地交給華夏作為賠償的一部分，但是華夏不能在隨后徹底中斷了夏荷貿易，同時還希望提高每人保留財產的份額。
對于朝廷希望在奪取領土后繼續保持貿易的心理，林耕是有所了解的，因此爽快的答應了荷蘭人的討價還價，只是對于荷蘭人希圖保留更多個人財產的要求做了堅定的抵制。此時，攻克各地荷軍堡塞的夏軍逐步返回巴達維亞，勝券在握的林耕便向荷蘭人下達了最后通牒，要求其在六月十五日中午前開城，逾期將視作拒絕投降。
在林耕的逼迫下，巴達維亞方面最終無奈的接受了通牒。
六月十五日上午，巴達維亞守軍開出城外，正式向劉文來投降。雙方隨后簽訂《椰城條約》，正式將荷屬東印度及荷屬斯里蘭卡、荷屬澳大利亞、荷屬印度商站全部割讓給華夏。而華夏方面則予以保證，一旦接收了細蘭等地之后，將派船運送東印度群島各地的荷蘭人（不含德意志雇傭兵）前往細蘭，隨后由細蘭等地的荷蘭船只運輸其歸國，并允許荷蘭方面今后繼續在科倫坡、馬塔拉等通商港口與華夏貿易。
此后，在華夏武成十六年六月至八月間，荷蘭在東印度群島各地尚在堅持的要塞在得到巴達維亞的命令后相繼投降；八月初，普利卡特和薩德拉斯兩地商棧迫于洋面上出現的夏軍艦船的威懾，宣布接受巴達維亞的命令將除商船以外的全部資產交予華夏。
九月初，夏軍大舉登陸細蘭，賈夫納方面最終也不得不同意將整個細蘭交予華夏，至此夏荷戰爭宣告結束，華夏不但將荷蘭聯合東印度公司驅逐出東印度群島和東部印度，更打開了前往南方方丈大陸的門戶。
夏荷戰爭的結局大大震驚了歐洲各國東印度公司，使得他們對露出獠牙的華夏帝國充滿了忌憚，然而華夏的開拓重點很快轉向方丈大陸及太平洋上諸多島嶼，并沒有進一步壟斷印度貿易，這使得葡萄牙、法國、丹麥、瑞典等與華夏相對友好的歐洲國家松了一口氣。
不過英國人就沒那么輕松了，生怕華夏徹底中斷中英貿易并對加爾各答、馬德拉斯等地發動進攻的不列顛東印度公司急忙撤換了丹佛等人，并從孟買管區派遣資深董事前往華夏道歉。為了不讓法國在中歐貿易中一枝獨秀獲取超額利益，華夏朝廷最終接受了英國人的認錯，并開出一張四萬英鎊的巨額罰單。
在東方實力有限的英國人不得不忍氣吞聲的接受了罰單，并暗中誓言復仇，只是迫于如日中天的華夏國勢只能暫且隱忍，但中英之戰就此埋伏了伏筆