再過了一百年，來到公元四千年，新人類的壽命已經是從前的十倍，平均壽命高達八百六十二歲，而他們的智力和體力都跟從前的人類完全不可同日而語。
更重要的是，新人類內部形成了更加精確的分工制度，新人類將所有的工作分為五個大類——戰士，技術，魅力，戰略，操作。
所有的職業都規劃在這五個系統之下，每個人都根據人類的需要，一代又一代的通過基因優化來使得自己與自己的子女更加適合自己的崗位。
這種方式使得新人類的生產力和戰斗力得到最大程度的發揮。
在這個時候，代表總數高達十億的一千兩百名人類代表，在“失落的歷史”再次會盟。通過這次會盟，新人類宣布他們已經厭倦了逃亡生涯，他們要殺回老家去。
在第二年，準備充足的新人類，在一千兩百人組成的的“星際大會”的組織下，向太陽系進發，進行復仇之戰。
這個時候，新人類才發現機器人也已經不再是過去的機器人。機器人的科技雖然發展沒有新人類那么快，但是比從前更加先進，而最可怕的是，他們擁有近乎無限的自我量產的能力。
當人類在“失落的歷史”一帶星系自我發展的時候，機器人已經蔓延了將近一百個太陽系那么大，總人口更是高達萬億。
這根本就是場無望的戰爭，于是，在進行了為時三十年的復仇戰爭，親手消滅了近千億機器人，自身也付出了喪生過億的代價之后，新人類不得不和機器人簽訂了《上海諒解條約，宣布媾和。
雖然簽署了和平協議，但是因為人口上的劣勢，新人類始終生存在機器人的包圍之中，惶惶不可終日。最后，這一問題也在公元四零六五年得到了解決——有一名科學家發現了打開前往新宇宙的方法。
這個宇宙便是阿爾法宇宙。
新人類決定全體移民到阿爾法宇宙，在經過了五十年的準備之后，新人類準備了足夠的艦隊防守機器人的進攻，然后便展開了人類全體遷移計劃。
在計劃進行的第三十二年，機器人發覺了新人類的異動，試圖和新人類分享這一通道，結果遭到了新人類防守艦隊毫不留情的開火。
之后是十年慘烈的“天堂之路”戰爭。
為了保護這條通道為人類所獨有，三千萬新人類留守艦隊付出了巨大的代價，最后，以僅兩萬人生還的犧牲，完成了新人類的整體大遷移。
當絕大部分新人類離開了原宇宙之后，新人類便關閉了阿爾法宇宙的通道。
這一年，被正式命名為阿爾法宇宙元年。
終于擺脫了機器人的陰影，但是新人類并沒有因此就真的走向天堂。
因為失去了威脅，新人類的生育率大大增加，總人口開始爆炸性的膨脹起來。
在短短的五百年間，新人類的總人數膨脹了一萬倍，高達十六萬億，而滿足其生活所需的星系，有原來的銀河系那么大。
由于無法承受這種過大負荷，新人類政府開始變得混亂起來，少數擁有最優秀基因的財閥和軍閥開始結合起來，開始主宰整個新人類的命運，新人類聯合政府變得名存實亡。
在阿爾法宇宙七百六十三年，這種現象達到了最高峰——被譽為“浩瀚之心”的路西法，篡奪了整個人類世界的統治權，宣布恢復帝制，并且大封十三諸侯王，做為支柱，共同來統治整個人類世界。
歷史上稱之為阿爾法第一帝國。
阿爾法第一帝國的壽命，并沒有超過路西法的壽命。
在統治了阿爾法宇宙四百年之后，路西法被他最親信的大將“黑騎士”馮歌德里曼襲殺，史稱“梨花之變”。
“梨花之變”后，阿爾法第一帝國隨之分崩離析。
短短三周，黑騎士就被十三諸侯王聯兵擊殺。
然而，十三諸侯王之中并沒有任何人足以擔當帝王之職。最后，在他們各自代表的財閥集團的支持下，十三諸侯王宣布解散帝國，將政府這一統一組織消滅，轉而成立星際大會這一松散組織。
除了貿易中心，傭兵工會，銀河艦隊工會，科技傳輸中心等集中核心權力之外，星際大會將一切政府權力都放棄。
新人類所zhan有的六十多萬顆有人以及無人星球，全部被拍賣為私產。
任何一個人，只要能夠繳交五百萬阿爾法硬通幣（一阿爾法硬通幣等于一萬阿爾法普通幣）的價格，都可以獲得提督的稱號，并且擁有一顆自己的星球。
星際大會一共有十三個紅領議員，以及一千個藍領議員。按照星際憲法，每個紅領議員擁有一百票的投票權，而一千個藍領議員每人只有一票投票權。
紅領議員的擔任者當然就是十三諸侯王，而藍領議員則是全人類中最大的一千個家族的族長，同時也是一千個財閥集團的代表人。
阿爾法歷一千五百七十年，機器人重新打開了前往阿爾法宇宙的通道。
為了應對這一劇烈形勢，新人類各大軍閥和財閥，不得不暫時統合在新人類領袖，年輕的默城提督的麾下。
然而，這種統合，只是暫時的，新人類各勢力之間，還是各自有著自己的盤算。
星際大會依然存在，并且依然發揮著主要的決策作用。
然而，這種群體決策模式，注定了是低效率，并且不符合戰爭時代的。
毫無疑問，必須有新的英雄人物，協助乃至于取代默城，來統合全體新人類，對抗強大的機器人集團。